喹诺酮(quinolone)类药物是非常常见的抗生素种类,主要作用于革兰阴性菌,是一种对细菌DNA螺旋酶具有选择性抑制作用的抗菌剂。目前,癌症仍然是人类死亡的主要原因之一,也是世界范围内的一个主要公共卫生问题。但是,有效治疗癌症的方法手段仍旧缺失,已有的癌症治疗方法不但无法有效治疗,甚至可能带来巨大的副作用。 研究发现喹诺酮结构是存在于许多具有良好抗癌活性的化合物中的重要结构特征,是潜在的酪氨酸激酶抑制剂和抗肿瘤拓扑异构酶Ⅰ抑制剂。喹诺酮类药物与其他抗癌药效团的杂交可能提供更有效的抗癌候选药物,其中一些已经被批准用于治疗癌症或正在进行临床试验。本数据库整合了已有报道的喹诺酮类化合物,构建了喹诺酮类化合物知识库,以辅助癌症的治疗。数据库共收录了436条化合物信息,涵盖了化合物名称、结构、基本理化性质、作用靶点、作用细胞、细胞毒性数据IC50及对应参考文献和链接,旨在为喹诺酮类抗癌药物的开发提供参考及研究基础,降低研究成本。
吴茱萸生物碱是从吴茱萸中提取的天然生物碱。据报道,这种生物活性生物碱具有广泛的生物活性,包括抗损伤、抗肥胖、血管扩张和抗炎作用。近年来,人们发现吴茱萸生物碱对多种肿瘤具有抑制肿瘤的作用。越来越多的证据表明,吴茱萸生物碱可以抑制肿瘤细胞的快速增殖,诱导细胞周期在一定阶段停滞,增加细胞凋亡的发生率,促进自噬,抑制微血管生成和迁移,调节免疫治疗。为了方便查询吴茱萸生物碱对常见肿瘤细胞株系的抑制效果和作用机制,方便后期进行结构改造,以期寻找到对肿瘤抑制作用明显的吴茱萸生物碱,构建了一个基于大量文献综述的抗肿瘤数据库。该数据库涵盖了吴茱萸生物碱的名称、结构、分子式、分子量、抗肿瘤细胞株系、IC50、作用靶点、临床阶段和对应链接等众多条目。癌症作为威胁人类健康的一大疾病,现目前抗恶性肿瘤药物主要有抗代谢物、烷化剂、抗肿瘤抗生素、抗肿瘤植物药等,如氟尿嘧啶、氮芥、放线菌素、长春新碱等,而抗肿瘤新药研发任重道远,吴茱萸作为一种传统中药,部分吴茱萸生物碱可以很好的发挥抗肿瘤作用,因此,该数据库将有助于抗肿瘤药物早期筛查,为药物研发做出一定贡献。
核苷及核苷酸类似物是人工合成的,经过一定化学修饰的物质,可以模拟机体内核苷及核苷酸,参与 DNA 或 RNA 合成,由于无法发挥正常功能,因此可以阻断细胞分裂或病毒复制等。除了参与核酸组成之外,核苷及核苷酸类似物还可以作用于机体内一些重要的酶,抑制酶活性,如人类和病毒聚合酶(DNA 依赖的 DNA 聚合酶、RNA 依赖的 DNA 聚合酶或 RNA 依赖的 RNA 聚合酶)、激酶、核苷酸还原酶、DNA 甲基转移酶、嘌呤和嘧啶核苷磷酸化酶和胸苷酸合成酶等。核苷和核苷酸类似物的这些作用机制在抑制癌细胞生长、病毒复制以及治疗其他适应症方面具有潜在的应用价值。 为了整合众多核苷类药物研究的数据资源和结果并促进比较研究,进行了文献综述和信息提取分析,从而构建了核苷类药物的知识库,包含553条信息,以辅助核苷类药物对于癌症及病毒的治疗。数据库涵盖了药物名称、结构式、结构、目录名、CAS 编号、相对分子质量、生物活性、靶点、通路、溶解度、浓度、参考文献题目及对应的网址来源。该界面支持查询功能,例如“药物的CAS注册号”和“结构”。因此,该核苷类药物数据库将有助于进一步从“老药新用”的思路去寻找核苷类药物自身的药效之外,对于癌症治疗方面的新适应症。