嗜酸氧化亚铁硫杆菌的铁代谢知识库数据库

• 科研项目名称
  • 中文名称：嗜酸氧化亚铁硫杆菌的铁代谢知识库
  • 建设时间：2020-10-20
• 数据库简介
  • 嗜酸氧化亚铁硫杆菌是一种兼性厌氧菌株，利用硫元素和亚铁离子获取能量，在工业上得到广泛应用。随着实验数据的积累，已经建立了该菌的代谢机制，动力学模型和相关数据库。但是，分散的数据不利于理解嗜酸氧化亚铁硫杆菌。我们通过整合公共数据库和查阅文献，构建了嗜酸氧化亚铁硫杆菌的铁代谢知识库（KIMAf），包括生物浸出基质数据库（DBS），生物浸出金属离子相关蛋白的数据库（MIRP），嗜酸氧化亚铁硫杆菌的生物信息学数据库（Af-info）和生物浸出动力学模型数据库（DDMB）。 DBS和MIRP整合了常见的生物浸出基质和金属相关的蛋白。Af-info和DDMB整合了核苷酸和蛋白质序列信息以及动力学模型。这个综合的系统将有助于理解嗜酸氧化亚铁硫杆菌的代谢机制和生物浸出过程。
• 完成地点
  • 中国.甘肃.兰州